上下文管理、记忆持久化与科研项目管理

记忆系统 SSOT 决策表（先查这里，再动手写）

两套记忆系统并存——跨会话 Light 记忆文件(user/feedback/project/reference + MEMORY.md 索引)与项目库 db09——极易把同一类信息写错地方或两头都写造成漂移。落盘前先按下表定位唯一权威落点(SSOT)，再决定是否需 MEMORY.md 索引双写。铁律：权威落点只有一个；MEMORY.md 只放索引行(指针)，绝不放权威正文。

表一：每类信息 → 唯一权威落点 + 是否双写

表二：边界裁决(易混三对，照此切)

写 lessons.md 须去偏科化(剥离研究方向前提，抽到对任意学科成立的层面)，a02 起草、归档点由用户拍板(详见下「跨项目教训回写」)。校验工具：scripts/check_project_card.py(日期/枚举/行格式/衔接链)、scripts/version_tag_reconcile.py(version_history↔git tag 对齐)。

持久化（用 Light 记忆系统 + 项目库 db09）

• 跨会话事实写入记忆文件(user/feedback/project/reference)，并在 MEMORY.md 加索引行。其中 feedback 记忆槽的「跨项目过程教训」部分结构化落地为 db09 顶层 `lessons.md`（与 projects/ 平级，格式见下）；feedback 记忆文件本身仍存个人偏好类反馈。
• 项目级状态写入 db09 的 project_card：project_name, goal, current_stage, confirmed_idea, data_status, method_status, experiment_status, paper_status, ppt_status, code_status, risk_list, next_actions, decision_log, version_history。
• 相对日期一律转绝对日期再存。
• 两层记忆模型（借 LangGraph checkpointer/Store 与 mem0 的作用域设计）：会话级状态(≈thread_id，短期、随会话压缩可丢)与项目级状态(≈跨会话的 Store/db09，长期、按"项目"namespace 持久)分开管理。关键事实即使能被自动抽取也要显式写入——自动记忆(mem0 式 LLM 抽取)会漏记，db09 是权威来源。

记忆写入机制（招牌功能，硬性定义）

四类记忆文件存哪、什么格式、何时写、何时读，照此执行，不得省略。

存哪（落盘路径）

全部存到 db09，每个项目一个独立目录（相对本技能目录为 ../../databases/db09-projects/projects/<project_name>/）：

databases/db09-projects/projects/<project_name>/
├── project_card.md       项目卡：14 字段总览（next_actions 在此）
├── terminology.md        术语/指标/创新点统一定义表（供 a07）
├── decision_log.md       重大决策时间线
└── version_history.md    论文/PPT/图表/代码各版本记录
（可选子目录 literature/ reviews/ submissions/ 见 db09 README）

<project_name> 用短横线英文 slug（如 dairygoat-detect-track）。已存在实例可直接参考：projects/dairygoat-detect-track/（四文件齐全；version_history.md 在未出正式版本前只记当前态、不编造历史版本）。

什么格式（四文件确切结构，模板见 db09 project_card_template.md）

1. project_card.md — 顶部 YAML frontmatter（project_name / created 绝对日期），正文 # 项目卡：<中文标题>，再用一个 ``yaml 代码块装 14 字段：project_name, goal, current_stage, confirmed_idea, data_status, method_status, experiment_status, paper_status, ppt_status, code_status, risk_list, next_actions，末两字段写 decision_log: 见 decision_log.md、version_history: 见 version_history.md。多行字段用 |` 块标量。
2. terminology.md — Markdown 表：| 类别 | 标准叫法 | 缩写 | 英文 | 备注 |，类别取 方法/数据集/指标/创新点；创新点行标准措辞须与论文/PPT/软著一字对齐。
3. decision_log.md — 每行一条：- [YYYY-MM-DD] 决策 — 理由 — 来源(m03/m04/m14…)。只追加不改写，保留时间线。
4. version_history.md — 每行一条：- [YYYY-MM-DD] 材料(论文/PPT/图/代码) vN — 变更摘要，与 git tag 对齐（见下「管理工具映射」）。

该记什么

项目背景、研究问题、已确认 idea、数据情况、实验进度、论文/PPT/图表/代码各自版本、投稿与审稿记录、用户偏好(写作风格/工具/格式)、目标期刊、格式要求、重要决策(decision_log)。 不记：代码结构、git 历史、能从仓库直接看出的东西。

项目阶段拆解

把项目拆成：资料调研→idea 构思→方案确认→数据准备→实验实现→结果分析→论文写作→图表制作→投稿准备→答辩展示→成果转化。每阶段建：

• 任务清单(可勾选)、时间线/甘特、里程碑、风险清单、版本记录。
• 落到工具时：一个阶段=一个里程碑(GitHub milestone，带 due 日期)，阶段内任务=带 - [ ] 复选框的条目，风险项打 risk 标记。- [x] 用于已完成项，便于自动统计进度。

管理工具映射（见 a09，具体用法/端点/参数见 references.md）

• 代码/文本/稿件版本→Git：里程碑用带注释标签 git tag -a v1.2.0（注释标签才被 git describe 识别），遵循 SemVer，论文/PPT 也打 tag 并与 version_history 对齐；CHANGELOG 按 Keep a Changelog；大文件交 DVC；git push --tags 才上传。
• 数据/实验→DVC / MLflow / W&B：DVC dvc add 生指针、dvc.yaml 定 stage、dvc exp run+metrics diff；MLflow start_run+log_param/metric/artifact 串 run_id；W&B init/log+Artifacts 血缘+Sweeps，记 run URL。data_status/experiment_status 挂对应 commit/run。
• 文献→Zotero、项目知识→Obsidian/Notion/Logseq/Markdown、进展→README+CHANGELOG：各自的 API 基址、限流、字段映射见 references.md。

更新纪律（硬性）

每次完成：资料搜索、idea 修改、实验运行、论文修改、PPT 修改、投稿返修——立即更新 db09 对应字段与 decision_log，避免长期项目上下文丢失。

触发→写入对照：idea 定稿→改 confirmed_idea + 追加 decision_log；实验跑完→改 experiment_status + next_actions；论文/PPT/代码出新版→改对应 *_status + 追加 version_history（并打 git tag）；方案变更/取舍→追加 decision_log；新术语/指标/创新点定名→补 terminology.md。

B-fact 引用三件套（硬性，禁裸写数值）：写 decision_log/data_status 引用 venue 计量(h_index/被引/分区) / 数据集许可/DOI / 外部数值 时,不当 db09 自带权威,必带三件套——快照值(可带 ≈) + `[snapshot YYYY-MM-DD, src=dbNN:文件#定位, 用前重核, 冲突信在线]`(venue 回指 db01:venues.csv、数据集回指 db04 卡、色值回指 db05 DTCG;palette.json 是样板)。读卡恢复状态时:带 last_checked 的快照若超期(计量 >90 天/许可 >365 天)给"需重核"提示,不直接当当前值汇报,投稿/用前以在线(venue_signal.py)或官方源重核。

跨项目教训回写（节制，避免噪声）：仅当某决策产生了可跨项目复用的过程教训——踩坑、被审稿/导师否掉、复现失败、某流程显著省时/避雷——才在追加 decision_log 的同时回写一条 lesson 到 db09 顶层 lessons.md（格式：- [YYYY-MM-DD] 阶段/场景 — 做法 — 结果(有效|失败) — 适用条件 — 来源项目slug）。日常项目内决策不强制回写。边界：方法选型事实归 db03 方法卡，个人偏好归 feedback 记忆，二者不进 lessons.md。去偏科化（回写时）：lesson 须剥离研究方向前提、抽到对任意学科成立的层面(如"三模块纯串联当创新点会被拒,须有方法层 delta"对任何 CV/ML 成立=可上;"白羊外观同质化弃 re-id"带方向前提=留 decision_log 不上 lessons);a02 起草、归档确认点由用户拍板。

写入步骤示例（落地一次实验进展）

刚跑完检测 baseline（项目 dairygoat-detect-track）的五步：① 读现状：Read project_card.md 看 experiment_status/next_actions 当前值；② 改项目卡：Edit 把 experiment_status 改为带具体指标的实测描述（如「E1 baseline 已跑：YOLOv11@1280，mAP 0.71」），同步勾掉/替换 next_actions 首条；③ 追加决策日志：decision_log.md 末尾加 - [日期] 决策 — 理由 — 来源；④ 记版本：有可复现 tag 则 version_history.md 加行并 git tag -a；⑤ 跨会话索引：涉用户长期偏好/项目背景则写 Light 记忆文件 + MEMORY.md 索引行。日期一律绝对日期（今天=系统 currentDate）。

会话开始时

先读项目库与记忆：定位 databases/db09-projects/projects/<project_name>/project_card.md，优先读 `next_actions` 字段确认"上次做到哪、下一步是什么"，必要时再读 decision_log 末几条与 version_history。会话长时被压缩后，靠 db09/记忆而非短期记忆恢复状态。

跳过已归档项目：罗列/恢复项目时跳过 project_card 带非空 archived: 字段的项目，只在活跃项目里恢复状态；除非用户点名该归档项目。完结项目按「项目归档协议」（见 references.md）加 archived: 日期 + 回写终版 lessons，不删目录、不挪路径。

复用历史教训：新项目立项，或选定方法/投稿策略前，先 Grep db09 顶层 lessons.md 检索同类"阶段/场景"关键词（如 方案确认/数据准备/投稿）的历史有效做法；命中可复用的，在写 decision_log 时注明"复用自 lesson [日期]"。

会话衔接（主动交接）

本技能是会话衔接协议的执行者（全局纪律见 CONVENTIONS.md §9）。当上下文将尽或一段任务收尾时，主动给用户留种，让下一个对话零成本接上——区别于 orchestrator §0 的被动断点恢复（事后救火），这是事前留种。

四类触发（宁早勿晚，阶段边界默认触发）：T1 上下文水位（对话很长/已读大量文件/感知到压缩摘要/用户说"快不行了"）、T2 任务完成（收尾主动给"下一步"提示词）、T3 阶段切换（orchestrator 检查点通过前）、T4 用户索要（"给我衔接提示词/开新对话继续"）。注意：单纯"继续写这段/继续润色"是单技能续写，不触发交接。

两件套产出（触发时同时交付）：①衔接卡落盘 .light/handoff/S<NN>-<slug>.md（模板 templates/handoff_card.md，与 passport.yaml 同级，<NN> 两位递增）；②按 templates/handoff_prompt.md 填好具体值后打印一段中文启动提示词，用户复制→新开对话→粘贴即续。无项目目录的轻对话只打印提示词、不落卡（已知局限）。

自包含 + 自传播：每张卡独立可读，下一个 agent 只读最新卡即可续上；沿卡内 parent_session 链可追到任意上级对话。每个接手会话收尾必须再造下一张卡 + 提示词，协议才不断链。衔接卡 ≠ 当前事实：接手后仍按 orchestrator §5 刷新 git/passport/db09/CI 证据。

完整触发判据、落盘规则、与断点恢复的关系见 references/session_handoff.md。 特定客户端：Hermes 多会话/压缩主链恢复（查 state.db 的 parent_session_id/archived/cwd 复原完整会话链）见 references/hermes_session_lineage_recovery.md——通用协议优先，此为单客户端细节。

衔接

是所有技能的状态中枢：m01–m17 的产出都在此登记，a06 的目录与之对应。

各工具的真实端点/参数/已知坑见 references.md。